เมื่อวันที่ 10 มิถุนายน 2560 ผู้สื่อข่าวรายงานความคืบหน้า เกี่ยวกับปัญหาโครงการก่อสร้างศูนย์กำจัดขยะมูลฝอย กลุ่มพื้นที่ 3 งบประมาณ 72 ล้านบาท ของเทศบาลตำบลนาแก อ.นาแก จ.นครพนม ซึ่งดำเนินการก่อสร้างมาตั้งแต่ปี 2553 แล้วเสร็จปี 2554 ในพื้นที่ ต.นาเลียง อ.นาแก จ.นครพนม แต่ภายหลังใช้งานได้ประมาณ 2 ปี เกิดปัญหา ถูกปล่อยทิ้งมาตั้งแต่ปี 2556 เนื่องจากมีปัญหาเครื่องจักรไม่สามารถใช้งานได้ และแบกภาระต้นทุนสูง ไม่มีงบประมาณสนับสนุน จนกระทั่ง สำนักงานตรวจเงินแผ่นดิน โดยสำนักตรวจสอบพิเศษภาค 5 จ.อุบลราชธานี ได้มีการเข้าไปตรวจสอบหาสาเหตุ และมีคำสั่งล่าสุดเมื่อเดือนเมษายน 2560 ชี้มูลว่า ใช้ประโยชน์ไม่ได้ตามวัตถุ ประสงค์ของโครงการ และไม่มีการใช้ประโยชน์ทั้งระบบ รวมทั้งไม่สามารถปรับปรุง หรือซ่อมแซมให้ใช้ประโยชน์อย่างอื่นได้ จนเป็นเหตุทำให้ทางราชการได้รับความเสียหาย พร้อมมีคำสั่งให้มีการตั้งคณะกรรมการสอบสวน ดำเนินคดีเกี่ยวกับการละเมิด รวมทั้งอาญา และแพ่ง ในส่วนที่เกี่ยวข้อง อยู่ระหว่างการดำเนินการ
โดยทางด้าน นายวิทยา แสงสุวรรณ นายกเทศมนตรีเทศบาลตำบลนาแก ระบุว่า ปัญหาเรื่องบ่อขยะเกิดขึ้นตั้งแต่ผู้บริหารชุดเดิม ที่วางโครงการไว้ ตั้งแต่ปี 2552 – 2553 ส่วนตนเข้ามาดำรงตำแหน่งช่วงปี 2557 ถึงปัจจุบัน หลังเกิดปัญหาตนได้วางแนวทางการแก้ไขปัญหา ในการหารือกับภาคเอกชนเข้ามาประมูลดำเนินการ บริหารจัดการ เพื่อแก้ไขปัญหาขาดแคลนงบประมาณ รวมถึงประสานไปยังสถาบันการศึกษาเอกชนที่มีความเชี่ยวชาญ เข้ามาตรวจสอบซ่อมแซม เพื่อให้เครื่องจักรสามารถใช้งานได้ เนื่องจากทางเทศบาลมีปัญหาในเรื่องของงบประมาณที่เข้าไปดูแล เพราะในการเดินเครื่องจะต้องมีค่าใช้จ่าย ตกเดือนละประมาณเกือบ 2 แสนบาท ทำให้เทศบาลตำบลนาแก มองว่าไม่คุ้มค่ากับงบประมาณ จึงต้องหยุดเดินเครื่อง และวางแนวทางในการกจัดขยะด้วยการฝังกลบไม่ให้ส่งผลกระทบต่อชุมชน และเกิดปัญหาขยะล้น
ล่าสุดทางด้าน นายธวัชชัย มณีกุลทรัพย์ อดีตนายกเทศมนตรีเทศบาลตำบลนาแก ได้ออกมาชี้แจงถึงปัญหาเกี่ยวกับโครงการกำจัดขยะของเทศบาลตำบลนาแกว่า ตนในฐานะที่เคยเข้าไปบริหารงานรับตำแหน่งนายกเทศมนตรีเทศบาลตำบลนาแก ในช่วงต้นปี 2553 ถึง ปลายปี 2556 ซึ่งหลังเข้ารับตำแหน่ง พบว่ากระบวนการจัดซื้อจัดจ้างหาผู้รับจ้าง ได้ทำตามขั้นตอนจนจบกระบวนการ ในยุคของผู้บริหารชุดเดิม ตั้งแต่ปี 2552 หลังตนเข้ารับตำแหน่งจึงต้องดำเนินการว่าจ้าง ต่อตามอำนาจหน้าที่ โดยยืนยันว่าไม่มีส่วนได้เสีย และไม่ได้มีส่วนเกี่ยวข้องในการเสนอโครงการมาแต่ต้น ซึ่งงบประมาณทางผู้บริหารชุดเดิม เสนอทั้งหมด จำนวน 86 ล้านบาท มีการประมูลผู้รับจ้างได้งานที่ประมาณ 72 ล้านบาท ถือว่ามีการฟันราคากันพอสมควร หลังจากการดำเนินการก่อสร้างจนแล้วเสร็จในปี 2554 โดยในการตรวจรับส่งมอบงานมือการตรวจสอบมาตรฐาน ถูกต้องตามแบบ ไม่มีการแก้ไข และมีการใช้งานได้จริง ตามสเปคที่กำหนด ยืนยันไม่มีการสอดไส้หรือหมกเม็ด
จนกระทั่งโครงการแล้วเสร็จ ตนและผู้บริหาร ได้วางแนวทางการบริหารจัดการ ในเรื่องกำจัดขยะมาต่อเนื่อง ทั้งการ ทำข้อตกลงกับองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นใกล้เคียง ที่มาใช้บริการ จะต้องมีค่าใช้จ่ายให้กับทางเทศบาลตำบลนาแก เป็นค่าบริหารจัดการ ซึ่งต้องยอมรับว่า ในการเดินเครื่องจักร และการดำเนินการคัดแยกกำจัดขยะ จะต้องมีค่าใช้จ่ายแน่นอน จากข้อมูลจะต้องมีค่าใช้จ่ายเดือนละไม่ต่ำกว่า 1.5 แสนบาท แต่เรามีรายได้ประมาณ 90,000 บาท หรือประมาณ 1 แสนบาท ส่วนที่เหลือจะต้องมีการบริหารจัดการ เพราะจะมองว่ามีผลกำไรอย่างเดียวไม่ได้ จึงได้ทำโครงการร่วมกับชุมชน ตั้งธนาคารขยะชุมชน ในการกำจัดขยะในครัวเรือน เพื่อลดปริมาณขยะตั้งแต่ต้นทาง ทำให้ชุมชนโพนแดง เทศบาลตำบลนาแก ได้รับรางวัลพระราชทาน ระดับประเทศ เป็นการลดต้นทุนในการกำจัดขยะของเทศบาล ไม่ต้องใช้งบประมาณรัฐเพียงอย่างเดียว
แต่ภายหลังตนพื้นตำแหน่ง เมื่อปลายปี 2556 ทำให้ขาดการบริหารงานต่อเนื่อง จนเกิดปัญหาเครื่องจักรต้องหยุดเดิน เพราะไม่มีการบริหารจัดการขยะในชุมชน ทำให้ปริมาณขยะเพิ่มขึ้น และต้องแบกภาระใช้งบประมาณภาครัฐสูงขึ้น ทำให้ต้องจอดเครื่องจักรปล่อยทิ้ง ถึงปัจจุบัน ผลที่ตามมาคือความชำรุดเสียหาย ทั้งนี้ในการออกมาชี้แจง ตนไม่มีเจตนาที่จะกล่าวโจมตี หรือให้ร้ายใคร เพียงต้องการยกปัญหาแนวทางแก้ไข ให้เกิดความชัดเจน ตนมองว่าในส่วนการพิจารณาสอบสวนตามขั้นตอนทางราชการให้ดำเนินการไป แต่สำคัญคือการบริหารจัดการวางแนวทางการแก้ไขปัญหา อย่ามองว่าเป็นโครงการของใครมาจากไหน ไม่ให้งบประมาณสูญเปล่าจะต้องเดินหน้าต่อไป ทั้งนี้หากจะมองว่าการกำจัดขยะจะต้องมีผลกำไรอย่างเดียวคงยาก สิ่งสำคัญจะต้องสร้างความร่วมมือกับชุมชน ในการช่วยลดต้นทุนการกำจัดขยะ เพราะถึงจะขาดทุนแต่คุ้ม หากเป็นการแก้ไขผลกระทบระยะยาวในการกำจัดขยะ ไม่ให้เกิดมลพิษ เกิดมลภาวะ ดีกว่าสร้างแล้วปล่อยทิ้ง สิ่งที่ตามมาคือผลกระทบกับชุมชน มีแต่ความเสียหาย ทางออกที่ดีคือการบริหารจัดการ